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Le Comité japonais pour l'UICN (UICN-J) a été créé en 1980, lorsque la Stratégie mondiale de la conservation a été lancée au Japon, dans le but d'échanger des informations sur l'UICN et de faciliter la coopération entre les membres de l'UICN au Japon. Certains des travaux majeurs menés par le Comité Japon sont le lancement de la réunion régionale des membres de l'UICN en Asie du Nord-Est en 1995 et le symposium international intitulé "Fontainebleau à Kyoto - Patrimoine mondial et tradition japonaise" commémorant le 50e anniversaire de l'UICN en 1998. En outre, les organisations membres liées à l'aire protégée ont créé le Comité japonais pour la Commission mondiale sur les aires de protection en Asie de l'Est (WCPA-EA-J) et ont tenu la 2e conférence sur les aires protégées d'Asie de l'Est à Kushiro en 1996. Le Comité a été officiellement reconnu comme un comité national par le Conseil de l'UICN en octobre 2001. En avril 2010, le comité comprenait environ 20 organisations membres, dont le ministère des Affaires étrangères et le ministère de l'Environnement. Il est présidé par M. Tsunao Watanabe, Centre japonais de recherche sur la faune sauvage, Université des Nations Unies. Le bureau est situé dans la Nature Conservation Society of Japan.